Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNA2D2Q9NY47 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D2Q9NY47 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA2D2Q9NY47 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA2D2Q9NY47 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D2Q9NY47 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D2Q9NY47 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D2Q9NY47 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms