Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLDND1Q9NY35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLDND1Q9NY35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLDND1Q9NY35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLDND1Q9NY35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLDND1Q9NY35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLDND1Q9NY35 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLDND1Q9NY35 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDND1Q9NY35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDND1Q9NY35 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDND1Q9NY35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDND1Q9NY35 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms