Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
COMMD8Q9NX08 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COMMD8Q9NX08 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COMMD8Q9NX08 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COMMD8Q9NX08 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COMMD8Q9NX08 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COMMD8Q9NX08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COMMD8Q9NX08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COMMD8Q9NX08 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COMMD8Q9NX08 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COMMD8Q9NX08 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COMMD8Q9NX08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COMMD8Q9NX08 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms