Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARPBPQ9NWS1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARPBPQ9NWS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARPBPQ9NWS1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARPBPQ9NWS1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARPBPQ9NWS1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PARPBPQ9NWS1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms