Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC3Q9NUD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZCCHC3Q9NUD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZCCHC3Q9NUD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZCCHC3Q9NUD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC3Q9NUD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC3Q9NUD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms