Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDREJQ9NTG1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDREJQ9NTG1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKDREJQ9NTG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDREJQ9NTG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKDREJQ9NTG1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDREJQ9NTG1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms