Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TSHZ2Q9NRE2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TSHZ2Q9NRE2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TSHZ2Q9NRE2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TSHZ2Q9NRE2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TSHZ2Q9NRE2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TSHZ2Q9NRE2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TSHZ2Q9NRE2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TSHZ2Q9NRE2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TSHZ2Q9NRE2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms