Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC24A3Q9HC58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC24A3Q9HC58 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC24A3Q9HC58 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC24A3Q9HC58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC24A3Q9HC58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC24A3Q9HC58 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms