Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZMAT3Q9HA38 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZMAT3Q9HA38 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZMAT3Q9HA38 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZMAT3Q9HA38 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZMAT3Q9HA38 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms