Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF3Q9H4W6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EBF3Q9H4W6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EBF3Q9H4W6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EBF3Q9H4W6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EBF3Q9H4W6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms