Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VPS16Q9H269 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
VPS16Q9H269 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VPS16Q9H269 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VPS16Q9H269 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VPS16Q9H269 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS16Q9H269 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS16Q9H269 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms