Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB17Q9H0T7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB17Q9H0T7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB17Q9H0T7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB17Q9H0T7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB17Q9H0T7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB17Q9H0T7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB17Q9H0T7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB17Q9H0T7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB17Q9H0T7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB17Q9H0T7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms