Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM8Q9BZR9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM8Q9BZR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM8Q9BZR9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM8Q9BZR9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM8Q9BZR9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms