Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP9-8Q9BYQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms