Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAP1LC3CQ9BXW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms