Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC106Q9BWC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC106Q9BWC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC106Q9BWC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC106Q9BWC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC106Q9BWC9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC106Q9BWC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms