Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC11Q9BVV2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC11Q9BVV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC11Q9BVV2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNDC11Q9BVV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNDC11Q9BVV2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNDC11Q9BVV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC11Q9BVV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FNDC11Q9BVV2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FNDC11Q9BVV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNDC11Q9BVV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms