Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PYM1Q9BRP8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PYM1Q9BRP8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PYM1Q9BRP8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PYM1Q9BRP8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PYM1Q9BRP8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PYM1Q9BRP8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PYM1Q9BRP8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PYM1Q9BRP8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PYM1Q9BRP8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PYM1Q9BRP8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PYM1Q9BRP8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PYM1Q9BRP8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PYM1Q9BRP8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PYM1Q9BRP8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PYM1Q9BRP8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms