Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLSTN3Q9BQT9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLSTN3Q9BQT9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLSTN3Q9BQT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLSTN3Q9BQT9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLSTN3Q9BQT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSTN3Q9BQT9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLSTN3Q9BQT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms