Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CMSS1Q9BQ75 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMSS1Q9BQ75 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMSS1Q9BQ75 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMSS1Q9BQ75 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CMSS1Q9BQ75 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMSS1Q9BQ75 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms