Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USB1Q9BQ65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USB1Q9BQ65 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USB1Q9BQ65 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USB1Q9BQ65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms