Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCA3Q99758 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCA3Q99758 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCA3Q99758 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCA3Q99758 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCA3Q99758 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCA3Q99758 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA3Q99758 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCA3Q99758 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCA3Q99758 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCA3Q99758 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCA3Q99758 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCA3Q99758 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCA3Q99758 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ABCA3Q99758 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ABCA3Q99758 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ABCA3Q99758 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCA3Q99758 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCA3Q99758 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCA3Q99758 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCA3Q99758 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCA3Q99758 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCA3Q99758 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms