Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITX2Q99697 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITX2Q99697 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX2Q99697 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX2Q99697 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITX2Q99697 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITX2Q99697 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms