Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHP1Q99653 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CHP1Q99653 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHP1Q99653 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHP1Q99653 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHP1Q99653 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHP1Q99653 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHP1Q99653 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHP1Q99653 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms