Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNN2Q99439 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNN2Q99439 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CNN2Q99439 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNN2Q99439 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNN2Q99439 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNN2Q99439 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms