Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC47.95■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
RSF1Q96T23 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
RSF1Q96T23 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
RSF1Q96T23 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
RSF1Q96T23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
RSF1Q96T23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
RSF1Q96T23 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
RSF1Q96T23 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.25
RSF1Q96T23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
RSF1Q96T23 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
RSF1Q96T23 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
RSF1Q96T23 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
RSF1Q96T23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
RSF1Q96T23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
RSF1Q96T23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.76■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.24
RSF1Q96T23 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC47.72■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
RSF1Q96T23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
RSF1Q96T23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
RSF1Q96T23 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
RSF1Q96T23 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
RSF1Q96T23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
RSF1Q96T23 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
RSF1Q96T23 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
RSF1Q96T23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
RSF1Q96T23 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
RSF1Q96T23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
RSF1Q96T23 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
RSF1Q96T23 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
RSF1Q96T23 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
RSF1Q96T23 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC47.44■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC47.41■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
RSF1Q96T23 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC47.37■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
RSF1Q96T23 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms