Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRELID3AQ96N28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRELID3AQ96N28 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3AQ96N28 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3AQ96N28 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRELID3AQ96N28 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms