Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC16BQ96JE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC16BQ96JE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC16BQ96JE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC16BQ96JE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC16BQ96JE7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC16BQ96JE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms