Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFRP2Q96HF1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFRP2Q96HF1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP2Q96HF1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFRP2Q96HF1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFRP2Q96HF1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms