Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPL38Q96DV4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL38Q96DV4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MRPL38Q96DV4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL38Q96DV4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL38Q96DV4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL38Q96DV4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL38Q96DV4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL38Q96DV4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms