Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINJ1Q92982 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NINJ1Q92982 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NINJ1Q92982 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms