Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFFLQ8WZ73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFFLQ8WZ73 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RFFLQ8WZ73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFFLQ8WZ73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFFLQ8WZ73 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RFFLQ8WZ73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms