Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG4AQ8WYN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG4AQ8WYN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG4AQ8WYN0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG4AQ8WYN0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATG4AQ8WYN0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATG4AQ8WYN0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATG4AQ8WYN0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATG4AQ8WYN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG4AQ8WYN0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms