Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM171Q8WVE6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM171Q8WVE6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM171Q8WVE6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM171Q8WVE6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM171Q8WVE6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms