Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC29Q8WV35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC29Q8WV35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC29Q8WV35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC29Q8WV35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC29Q8WV35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC29Q8WV35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC29Q8WV35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC29Q8WV35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms