Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRUNE2Q8WUY3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRUNE2Q8WUY3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRUNE2Q8WUY3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRUNE2Q8WUY3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRUNE2Q8WUY3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRUNE2Q8WUY3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRUNE2Q8WUY3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRUNE2Q8WUY3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRUNE2Q8WUY3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms