Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC12Q8WUD4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC12Q8WUD4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC12Q8WUD4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC12Q8WUD4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC12Q8WUD4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC12Q8WUD4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC12Q8WUD4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC12Q8WUD4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms