Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ1

CD300LF, CMRF35-like molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LFQ8TDQ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300LFQ8TDQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300LFQ8TDQ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD300LFQ8TDQ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD300LFQ8TDQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD300LFQ8TDQ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms