Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS37AQ8NEZ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37AQ8NEZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS37AQ8NEZ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37AQ8NEZ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37AQ8NEZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms