Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHDHQ8NE62 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHDHQ8NE62 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHDHQ8NE62 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHDHQ8NE62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHDHQ8NE62 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms