Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC71LQ8N9Z2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC71LQ8N9Z2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC71LQ8N9Z2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC71LQ8N9Z2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71LQ8N9Z2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71LQ8N9Z2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms