Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MSL3Q8N5Y2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MSL3Q8N5Y2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MSL3Q8N5Y2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MSL3Q8N5Y2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MSL3Q8N5Y2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MSL3Q8N5Y2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MSL3Q8N5Y2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MSL3Q8N5Y2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSL3Q8N5Y2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MSL3Q8N5Y2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MSL3Q8N5Y2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms