Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00471Q8N535 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00471Q8N535 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00471Q8N535 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00471Q8N535 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00471Q8N535 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00471Q8N535 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms