Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNX2Q8N448 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LNX2Q8N448 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNX2Q8N448 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNX2Q8N448 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNX2Q8N448 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNX2Q8N448 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNX2Q8N448 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LNX2Q8N448 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LNX2Q8N448 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LNX2Q8N448 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNX2Q8N448 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNX2Q8N448 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNX2Q8N448 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNX2Q8N448 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms