Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP3Q8IZU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP3Q8IZU3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP3Q8IZU3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP3Q8IZU3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP3Q8IZU3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms