Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED8Q8IZ13 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED8Q8IZ13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED8Q8IZ13 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED8Q8IZ13 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED8Q8IZ13 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZBED8Q8IZ13 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED8Q8IZ13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms