Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC170Q8IYT3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC170Q8IYT3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC170Q8IYT3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC170Q8IYT3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC170Q8IYT3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC170Q8IYT3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC170Q8IYT3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms