Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL7

MSRB3, Methionine-R-sulfoxide reductase B3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB3Q8IXL7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB3Q8IXL7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRB3Q8IXL7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MSRB3Q8IXL7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSRB3Q8IXL7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSRB3Q8IXL7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSRB3Q8IXL7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSRB3Q8IXL7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms