Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX18

DHX40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX40Q8IX18 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX40Q8IX18 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX40Q8IX18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX40Q8IX18 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX40Q8IX18 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DHX40Q8IX18 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DHX40Q8IX18 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms