Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.53■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
P3H3Q8IVL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
P3H3Q8IVL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.38■■■■■ 4.37
P3H3Q8IVL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
P3H3Q8IVL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
P3H3Q8IVL6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
P3H3Q8IVL6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
P3H3Q8IVL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
P3H3Q8IVL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
P3H3Q8IVL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
P3H3Q8IVL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
P3H3Q8IVL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
P3H3Q8IVL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
P3H3Q8IVL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
P3H3Q8IVL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
P3H3Q8IVL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
P3H3Q8IVL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
P3H3Q8IVL6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
P3H3Q8IVL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
P3H3Q8IVL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
P3H3Q8IVL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
P3H3Q8IVL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
P3H3Q8IVL6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
P3H3Q8IVL6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms